是進(jìn)化樹(shù)中處于一組被分析物種之外的，具有相近親緣關(guān)系的物種。

指在進(jìn)化樹(shù)上任何一個(gè)分支節(jié)點(diǎn)，一個(gè)父分支都只能被分成兩個(gè)子分支。

通過(guò)一組相關(guān)的基因或者蛋白質(zhì)的多序列比對(duì)或其他性狀，可以研究推斷不同物種或基因之間的進(jìn)化關(guān)系。

通過(guò)序列的相似性檢索得到許多相似性序列，將這些序列做一個(gè)總體的比對(duì)，以觀察它們?cè)诮Y(jié)構(gòu)上的異同，來(lái)回答大量的生物學(xué)問(wèn)題。

BLAST搜索的過(guò)濾選項(xiàng)。指序列中包含的重復(fù)度高的區(qū)域，如polyA.。