指在進化樹上任何一個分支節(jié)點，一個父分支都只能被分成兩個子分支。

通過一組相關(guān)的基因或者蛋白質(zhì)的多序列比對或其他性狀，可以研究推斷不同物種或基因之間的進化關(guān)系。

通過序列的相似性檢索得到許多相似性序列，將這些序列做一個總體的比對，以觀察它們在結(jié)構(gòu)上的異同，來回答大量的生物學(xué)問題。

BLAST搜索的過濾選項。指序列中包含的重復(fù)度高的區(qū)域，如polyA.。

在一級數(shù)據(jù)庫、實驗數(shù)據(jù)和理論分析的基礎(chǔ)上針對特定目標衍生而來，是對生物學(xué)知識和信息的進一步的整理。