生物信息學(xué)章節(jié)練習(xí)(2020.05.17)

在替換矩陣中，每個(gè)位置的打分是在相關(guān)蛋白局部比對(duì)模塊中觀察到的替換的頻率而獲得的，每個(gè)矩陣被修改成一個(gè)特殊的進(jìn)化距離。

2.名詞解釋模塊替換矩陣（BLUSUM）

3.問(wèn)答題生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的組成包括哪些部分？數(shù)據(jù)庫(kù)有哪些類型？

參考答案：生物信息學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù)的組成包括一級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)和二級(jí)數(shù)據(jù)庫(kù)。數(shù)據(jù)庫(kù)的類型包括核算和蛋白質(zhì)一級(jí)結(jié)構(gòu)序列數(shù)據(jù)庫(kù)、基因組數(shù)據(jù)庫(kù)、生物大分...

4.問(wèn)答題什么是系統(tǒng)發(fā)育分析？

參考答案：系統(tǒng)發(fā)育分析是研究物種進(jìn)化和系統(tǒng)分類的一種方法，研究對(duì)象為攜帶遺傳信息的生物大分子序列，采用特定的數(shù)理統(tǒng)計(jì)算法來(lái)計(jì)算生物...

5.填空題系統(tǒng)發(fā)育學(xué)的研究方法有：（）

參考答案：表現(xiàn)型分類法，遺傳分類法和進(jìn)化分類法

6.問(wèn)答題在序列比對(duì)時(shí)DNA序列和蛋白質(zhì)序列得分矩陣的意義有何不同？

參考答案：核酸序列得分系統(tǒng)比較簡(jiǎn)單，只需要考慮匹配、不匹配及空位罰分這三種情況；而蛋白序列比對(duì)就要復(fù)雜得多，除了考慮匹配和空位罰分...

7.名詞解釋Ab initio prediction

參考答案：蛋白質(zhì)三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)方法—從頭預(yù)測(cè)法，在既沒(méi)有已知結(jié)構(gòu)的同源蛋白質(zhì)、也沒(méi)有已知結(jié)構(gòu)的遠(yuǎn)程同源蛋白質(zhì)的情況下，只能采用從頭預(yù)...

8.名詞解釋EST

參考答案：表達(dá)序列標(biāo)簽—是從一個(gè)隨機(jī)選擇的cDNA克隆，進(jìn)行5’端和3’端單一次測(cè)序挑選出來(lái)獲...

9.問(wèn)答題HGP選擇作為研究人類的四大“模式生物“有哪些？

酵母、線蟲(chóng)、果蠅、小鼠。

10.名詞解釋BioPerl

是Perl語(yǔ)言專門(mén)用于生物信息學(xué)、基因組學(xué)及其他生命科學(xué)領(lǐng)域的工具與函數(shù)模塊集。